普通木结构的四合院建筑，造价远超钢筋水泥结构，这不仅仅有木材本身价值的因素，还包括木材复杂的处理程序。简单来说，新砍伐的木材不能直接用于建筑，而是需要经过很长时间的干燥和防腐处理，才能真正被建筑所使用。
一、木材的干燥
木材的干燥包括天然方法和人工方法，不同形式的木材的干燥方法又有不同。
成材贮存主要是码通风垛，露天或搭建气干棚。原木锯解后按不同树种，不同规格、等级的板、枋材分别堆垛。堆垛时，木板之间及木垛之间均留有空隙以利通风。原木含水率过高或贮存时间较长时，锯解后的板材还需要进行防霉、防腐、防蛀处理。如果要做人工干燥，也可在进窑前先经过一段时间天然气干，这样可以降低干燥成本。
原木贮存期一般为2～3年，若不加任何保护措施，原木存放4年以上，则基本已成等外材，而失去使用价值。原木存放3年以上，内部含水率依然在30～40%，或更高。因此，对古建筑用原木，在条件许可时，可以一次性投资采用人工干燥措施。
高频加热和微波加热是大枋材，特别是原木干燥的有效方式。高频加热和微波加热都属于内部加热，是电磁波加热方式的一种。这种加热方式是通过内部物质本身发热，实现内部和外部同时加热的一种处理方式。
二、木结构的防腐
木材防腐是指用专门的一类化学物质处理木材，杀死危害木材的各种生物或阻止其生长的方法。所用有毒药剂称为“木材防腐剂”。为保证效果，木材必须要达到一定的吸药量，为达到吸药量，应该根据具体情况采用不同的处理方法，具体方法非常复杂，这里不再赘述。
木材本身的价值，木材的处理程序，以及木结构独特的建筑工艺，显著拉高了木结构建筑的造价。因此，建四合院尽量选择钢筋水泥结构，不仅建造成本低，且后续维护也比较简单。