水利工程的质量是工程建设的核心，是决定工程建设成效之关键，而工程造价则是一个重要的经济技术指标。投资方都想在保证工程质量的同时降低工程造价，黄河防洪工程建设初期普遍把控制工程造价的主要精力放在预结算上，算细账，控制的目的不够理想，在一些特殊项目上甚至出现“三超”现象（即概算超估算，预算超概算，决算超预算），很大程度上影响了水利工程的经济效益。
2、造成工程造价“三超”的基本原因
2.1一些匆忙上马的新建工程，如汛前应急加固项目，由于在投资决策阶段对工程标准估计不足，工程建设中设计变更、现场签证随着工程进展经常发生，从而导致投资不足，造成资金缺口。同时，也由于资金短缺导致工程的竣工日期一拖再拖，投资方和承包方因此背上了沉重的包袱。
2.2设计对工程造价起着决定性的作用。据统计分析，在初步设计阶段，影响项目造价的可能性有25%～95%；在技术设计阶段影响项目投资的可能性有35%～75%；在施工图设计阶段影响工程造价的可能性有5%～35%.很显然，在项目做出投资决策后，控制项目投资的关键在于设计。设计工作得不到应有的重视和监督，很多水利工程没有推行限额设计。设计部门较重视技术上的可行性，相对而言对经济上和合理性重视不够，特别是某些设计人员存在设计保守现象，采用增加钢筋含量、提高安全系数等现象，造成投资成本的增加。
2.3在水利工程施工阶段，有些承包方出于追逐利润最大化的目的，虚报、多报工程价款时有发生。监理方对项目的质量、工期予以高度重视，但有些监理单位对造价的控制相对薄弱，这也是工程造价超计划的一个原因。