过去，四合院营造时讲究极多，从定位、定时到确定每幢建筑的具体尺度、用料、装饰色彩，以及摆设物品、种植树木等都会涉及风水学。四合院大门内外讲究设影壁墙，风水学上说若门气过盛即会冲淡地气，影壁能阻断外来视线，保持院内的私密性，更避免“回风反气”。
按照中国传统的风水理论，四合院正房坐北朝南，即“坐坎朝离”;大门一般都开在东南角，即“坎宅巽门”。这系从八卦方位得到的启示，东南方向是和风、润风吹进的方位，乃吉祥之位;而北方坎位为吉位，在五行中代表水，将正房建在正北，意味着可以避开火灾。
北京的四合院虽说是严格按照风水学说所建造，但今天来看仍不失为具有一定的科学性。比如房屋的采暖通风等考虑到了北半球日照及风向特性。四合院朝南，冬季可以最大限度地汲取阳光;北侧封闭，可以抵御冬季凛冽的寒风;而在南侧开设门窗，既便于在冬季享受和煦的阳光，又利于夏季空气的流通。